بقایی خواستار حفاظت از مسجد الاقصی و دیگر اماکن مذهبی در فلسطین شد.
اسماعیل بقایی سخنگوی وزارت امور خارجه حمله پنجشنبه شب 28 خرداد 1405 به دو مسجد در رام الله در کرانه باختری رود اردن و نیز حمله به منازل، ضرب و شتم فلسطینی ها و تخریب اموال و مزارع آنان را محکوم کرد و ضمن ابراز تاسف عمیق خود از حقوق بشر برای جنایتکاران، ادامه داد: انفعال سازمان ملل متحد و شورای امنیت این سازمان در قبال جنایات رژیم نژادپرست صهیونیستی، موجب تداوم این رژیم شده است که این رژیم قانون شکنی و شدیدترین جنایات بین المللی را علیه فلسطینیان و سایر کشورهای منطقه مرتکب شده است.
به گزارش ایرنا، بقایی با یادآوری مسئولیت شرعی و قانونی دولت های اسلامی و سازمان همکاری اسلامی برای حمایت از ملت فلسطین در دستیابی به حق تعیین سرنوشت و توقف جنایات اسرائیل، خواستار اقدامات عملی سازمان همکاری اسلامی برای حفاظت از مسجد الاقصی و سایر اماکن مذهبی فلسطین شد.
